| Unsur | Warna | Makna |
|---|---|---|
| Garis lengkung 5 sudut | – | Melambangkan sila-sila Pancasila |
| Lambang Yayasan Pondok Pesantren Qomaruddin | Kuning | Keagungan |
| Menara Kusuma Buana dengan kubah lafadz Allah | Putih | Kekokohan, dakwah menuju kejayaan Islam |
| Kitab bergaris empat | Kuning | Empat dasar: Qur’an, Hadits, Ijma’, Qiyas |
| Pena bulu angsa pecahan sembilan | Putih | Pendidikan & pengajaran, mempertahankan pesantren & ulama |
| Jagat (bumi: laut & daratan) | Laut biru, daratan hijau | Kemakmuran & kesejahteraan |
| Sembilan kurung kurawal | Hitam | Ikatan perjuangan NU, keindahan & kemegahan |
| Garis bujur (6) | – | Rukun iman |
| Garis lintang (5) | – | Rukun Islam |